オンライン決済の手数料とは？相場比較やおすすめのサービスについて解説

この記事は、オンライン決済の導入を検討している事業者さま向けに、決済手数料をはじめ、初期費用や月額費用、振込手数料など、オンライン決済にかかる費用の全体像をわかりやすく解説します。クレジットカード決済やコンビニ払いなど決済手段ごとの手数料の相場比較や、手数料を抑えるための具体的な方法、オンライン決済サービスを選ぶ際のポイントも紹介。よくある質問まで幅広くカバーした内容です。

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オンライン決済の手数料とは？

オンライン決済の手数料とは、ECサイトやWebサービスでクレジットカード決済・コンビニ決済・QRコード決済などを使えるようにする際に、事業者が決済代行会社やカード会社へ支払う費用のことです。購入者ではなく、商品やサービスを販売する事業者側が負担するのが一般的です。
手数料の中身は1種類ではありません。売上金額に対して一定の割合でかかる「決済手数料」のほか、導入時の「初期費用」、毎月発生する「月額費用」、決済1件ごとにかかる「トランザクション費用」、売上金を受け取る際の「入金手数料（振込手数料）」などに分かれます。
決済手数料の料率だけを見ると安く感じても、ほかの費用を合わせると割高になるケースもあるため、総額で比べることが大切です。

【決済手段別】オンライン決済の手数料における相場比較

オンライン決済の手数料は、導入する決済手段によって大きく変わります。クレジットカード決済のように売上金額に対して一定の料率がかかるものもあれば、コンビニ決済や銀行振込のように1件ごとに決まった金額がかかるものもあります。また、同じ決済手段でも、業種や売上規模、契約する決済代行会社によって手数料は上下します。
ここでは、主な決済手段ごとの手数料の相場と特徴を一覧で比較します。

※手数料は決済代行会社や契約条件、業種、取扱高などによって変わります。実際の金額は各社の見積もりでご確認ください。

決済手数料以外にかかる費用の内訳

オンライン決済を導入・運用する際には、決済手数料のほかにもいくつかの費用がかかります。料率だけを見て契約すると、あとから想定外のコストがふくらむこともあるため、すべての費用を合わせた「実際の負担額」で比べることが大切です。主な費用は以下のとおりです。

※金額は決済代行会社や契約条件、業種、取扱高によって変わります。実際の費用は各社の見積もりでご確認ください。

オンライン決済の手数料を抑える方法

オンライン決済の手数料は、契約した時点で決まって終わりではなく、選び方や運用の仕方しだいで負担を軽くすることができます。大切なのは、決済手数料の料率だけに注目するのではなく、初期費用や月額費用、トランザクション費用などを含めた総額で考えることです。
たとえば、複数の決済手段を決済代行会社でまとめて契約する、自社の売上規模や決済件数に合った料金体系をいくつかの会社で比べる、取扱高が増えたタイミングで手数料の見直しを相談する、といった方法があります。どれも特別な知識がなくても取り組めるものばかりです。
ここでは、オンライン決済の手数料を抑えるための具体的な方法を紹介します。

決済代行会社を利用して契約をひとつにまとめる

決済手段ごとにカード会社や決済サービス会社と個別に契約すると、審査書類の準備や管理画面の確認など、手間とコストが決済手段の数だけ増えてしまいます。決済代行会社を利用すれば、複数の決済手段をまとめて契約でき、手数料や条件も比べやすくなることを説明します。あわせて、店舗決済とオンライン決済を同じ会社でまとめられる点にも触れると、自社サービスの強みにつなげやすくなります。

自社の売上規模に合った料金体系を複数社で比較する

決済代行会社の料金体系には、月額費用などの固定費がかかる代わりに料率が低いプランと、固定費がかからず決済手数料のみのプランがあります。どちらが得になるかは月々の売上や決済件数によって変わるため、自社の取引規模に当てはめて試算する方法を解説します。また、見積もりは1社だけで決めず、2〜3社から取り寄せて、初期費用やトランザクション費用まで含めた総額で比べる大切さも伝えます。

取扱高が増えたら手数料の見直しを相談する

手数料の料率は契約時の条件のまま固定されるとは限らず、取扱高が増えたタイミングで決済代行会社に引き下げを相談できる場合があることを説明します。相談の際は、直近の取引実績や今後の売上見込みを具体的な数字で示すと、条件を検討してもらいやすくなるといった実務的なポイントも入れます。ただし、料率が一律で決まっているサービスでは交渉が難しい場合もあるため、その点も補足します。

オンライン決済サービスを選ぶポイント

オンライン決済サービスは数多くあり、手数料や機能、サポート内容はサービスごとに異なります。導入後に「思っていたより費用がかさむ」「使いたい機能がなかった」とならないためには、契約前にいくつかの観点から比べておくことが大切です。
特に確認しておきたいのは、手数料を含めた費用の総額と売上金が入金されるまでの期間、顧客の個人情報や決済データを守るための安全対策、そして今使っているネットショップのシステムや請求書・メール送信などのツールと連携できるかどうかです。手数料の安さだけで選んでしまうと、資金繰りへの影響や情報漏えいなどのトラブル、導入後の作業負担の増加につながるおそれもあります。
ここでは、オンライン決済サービスを選ぶ際に押さえておきたいポイントを解説します。

手数料を含めた費用の総額と入金までの期間を確認する

決済手数料の料率だけでなく、初期費用や月額費用、振込手数料なども合わせた総額で比べることの大切さを説明します。あわせて、売上金が口座に入金されるまでの期間にも触れ、資金繰りへの影響を考えて選ぶ必要があることを伝えます。入金を早められるサービスでは、別途手数料がかかる場合もあるため、その点も補足します。手数料の抑え方は前のH2で詳しく触れているため、ここでは要点にとどめます。

顧客情報を守るセキュリティ対策が整っているか確認する

オンライン決済では、顧客の個人情報やカード情報を扱うため、安全対策が十分なサービスを選ぶ必要があることを説明します。カード業界の国際的なセキュリティ基準（PCI DSS）への準拠や、本人確認の仕組み（EMV 3-Dセキュア）、不正利用を見つける機能などの有無を確認するポイントとして紹介します。情報漏えいが起きると、顧客だけでなく自社の信用も大きく損なうことにも触れます。

今使っているシステムやツールと連携できるか確認する

すでに運用しているネットショップのシステムや、請求書の発行・メール送信などのツールと連携できるかを確認する大切さを説明します。連携できない場合、追加の開発が必要になり、導入費用や期間が想定以上にかかることがあります。また、連携によって支払い案内の送付や入金の確認を自動化できれば、手作業によるミスや業務の手間を減らせることも伝えます。

オンライン決済を導入するならアルファノートがおすすめ

売上金の入金は月1回から最大月8回まで選べるため、資金繰りに合わせた運用が可能です（※業種によりご案内できるプランが変わります）。決済ページは、当社が用意した画面を使ってすぐに始められる「リンク型」と、カード情報を暗号化して自社サイト上で決済を完結できる「トークン型」から選べ、WordPressのネットショップ用プラグイン「WooCommerce」やEC-CUBEなどとの連携、月額課金（サブスクリプション）にも対応しています。
さらに、店舗向けの決済端末もあわせて導入できるため、オンラインと店舗の売上管理を1社にまとめられる点も特長です。決済手段が増えるほど、管理画面や入金サイクルがバラバラになり、売上確認や経理処理の負担が増えるという課題もあります。アルファノートでは、複数の決済データを一元管理できる仕組みを提供しており、日々の売上確認や月次の経理処理をスムーズに行うことが可能です。導入後の運用サポート体制も整っているため、キャッシュレス決済に不慣れな事業者さまでも安心して利用を始めていただけます。
決済手段の充実は、来店機会の確保やオンラインでの購入離脱防止につながり、売上拡大に直結する重要な施策です。PayPayをはじめとするキャッシュレス決済の導入・見直しをご検討の際は、自社に合った決済環境を構築するパートナーとして、ぜひアルファノートにご相談ください。

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オンライン決済手数料に関するよくある質問

オンライン決済の手数料は誰が負担する？

オンライン決済の手数料は、基本的に商品やサービスを販売する事業者（加盟店）が、決済代行会社やカード会社に支払います。一部の支払い方法では、手数料の一部または全額を購入者に負担してもらう設定ができる場合もあります。一方、クレジットカード決済については、カード会社との契約（加盟店規約）で、手数料を理由に購入者へ代金を上乗せすることが原則として認められていません。

決済手数料に消費税はかかる？

契約の形によって扱いが変わります。事業者がカード会社と直接契約している場合、決済手数料は消費税がかからない「非課税」として扱われるのが一般的です。一方、決済代行会社を通して契約している場合は、決済代行会社の仲介サービスに対する料金とみなされ、消費税がかかるケースが多くなります。契約前に確認することをおすすめします。